ISI a établi un partenariat avec une nouvelle école malienne nommée Institut Supérieur d’Informatique et Gestion des Affaires (SUP. IGA).
Ce partenariat comprend le transfert des connaissances que l’Institut a développées et acquises vers SUP. IGA. Ce partage se fait tant au niveau des contenus de cours que du savoir-faire pédagogique. Des enseignants de SUP. IGA viendront entre autres faire des séjours en perfectionnement à l’Institut Supérieur d’Informatique ISI.
Chaque année, lors de visites au Mali, ISI validera l’équivalence des diplômes par le biais d’examens. L'école assurera également l’intégration en stage au Québec des finissants de SUP.IGA les plus méritants.
Quatre des programmes offerts chez ISI sont dispensés depuis l’ouverture de l’établissement. La première rentrée de SUP. IGA s’est effectuée en novembre 2009.